MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 2

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008538	TGC	2	6	13	18	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008538	ATAG	2	8	50	57	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008538	CGC	2	6	1018	1023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008538	GCA	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008538	TTC	2	6	1107	1112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008538	TCAC	2	8	1128	1135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008538	CAGG	2	8	1228	1235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008538	GGT	3	9	1948	1956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008538	CAA	3	9	2004	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008538	CCG	2	6	2042	2047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008538	GTC	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008538	CTC	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008538	GAG	2	6	2192	2197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008538	GAA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008538	AT	3	6	2236	2241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008538	GGC	2	6	2345	2350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008538	TTG	2	6	4230	4235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008538	CAG	2	6	4250	4255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008538	CTG	3	9	4286	4294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008538	AAC	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008538	TGG	2	6	6779	6784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008538	CGG	2	6	8265	8270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008538	CGC	2	6	8271	8276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008538	GCC	2	6	8281	8286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008538	TCT	2	6	15548	15553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008538	CTA	2	6	16184	16189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008538	CAA	2	6	16245	16250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008538	AGC	2	6	16595	16600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008538	CGA	2	6	16601	16606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008538	GAA	2	6	20035	20040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008538	CCT	2	6	20045	20050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008538	AGG	2	6	20054	20059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008538	TC	3	6	20084	20089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008538	GATCCG	2	12	20099	20110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008538	ACA	2	6	20118	20123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008538	ACT	2	6	20162	20167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008538	TGG	2	6	22045	22050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008538	GTGG	2	8	22062	22069	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008538	TTG	2	6	22071	22076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008538	TCC	2	6	22201	22206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008538	GCC	2	6	25245	25250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008538	GCA	2	6	25274	25279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008538	CTG	2	6	25889	25894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008538	TGG	2	6	26001	26006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008538	GCC	2	6	26035	26040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_008538	GCC	2	6	26067	26072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008538	T	6	6	26073	26078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008538	AACT	2	8	26169	26176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008538	CCG	2	6	26220	26225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008538	CG	3	6	26236	26241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008538	CAGGC	2	10	26249	26258	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008538	GCACCG	2	12	26317	26328	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008538	CCCT	2	8	26345	26352	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_008538	CCA	2	6	26966	26971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008538	CCGG	2	8	26995	27002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008538	GC	3	6	27013	27018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008538	CCG	2	6	28724	28729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008538	CGGCC	2	10	28761	28770	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_008538	GCCGGG	2	12	29245	29256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008538	GAC	3	9	29271	29279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008538	GAC	2	6	29428	29433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008538	G	7	7	29562	29568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008538	GGCCG	2	10	29577	29586	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_008538	TCG	2	6	29596	29601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008538	CGG	2	6	29659	29664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008538	ATGCA	2	10	30087	30096	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008538	TGA	2	6	30127	30132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008538	GAA	2	6	31625	31630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008538	ACC	2	6	31643	31648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008538	CGG	2	6	31679	31684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008538	CCGG	2	8	31741	31748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008538	TTCA	2	8	31812	31819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008538	G	6	6	33392	33397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008538	GAAC	2	8	33402	33409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008538	CCA	2	6	34017	34022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008538	GCC	2	6	34040	34045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008538	GCT	2	6	34054	34059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008538	CAT	2	6	34095	34100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008538	GC	3	6	35108	35113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008538	TCAA	2	8	35130	35137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008538	CCAG	2	8	35151	35158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008538	TCC	2	6	36542	36547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008538	GCG	2	6	36587	36592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008538	GTG	2	6	36635	36640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008538	GTT	2	6	36751	36756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008538	ATG	2	6	36765	36770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008538	CGG	2	6	37724	37729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008538	CCG	2	6	37730	37735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008538	AGC	2	6	37738	37743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008538	CGC	2	6	37756	37761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008538	GTGG	2	8	40627	40634	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008538	ATA	2	6	40661	40666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008538	GCGTG	2	10	40713	40722	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008538	ACC	2	6	40740	40745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008538	AGG	2	6	40757	40762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008538	GA	3	6	41464	41469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008538	TGC	2	6	41592	41597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008538	GGC	2	6	41626	41631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008538	TTC	2	6	41636	41641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008538	CGG	2	6	41644	41649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008538	GC	3	6	42756	42761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008538	ATC	2	6	42827	42832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008538	AC	3	6	46445	46450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008538	AGG	2	6	47107	47112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008538	CCATC	2	10	48485	48494	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_008538	CCT	2	6	49853	49858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_008538	CACGC	2	10	49916	49925	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_008538	CTT	2	6	50047	50052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008538	CACC	2	8	50086	50093	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_008538	GCCG	2	8	50094	50101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008538	TGGG	2	8	50102	50109	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008538	CA	4	8	50202	50209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008538	ACT	2	6	50257	50262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008538	TTG	2	6	50284	50289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008538	GCAC	2	8	50470	50477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008538	AGT	2	6	50573	50578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008538	GTG	2	6	51603	51608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008538	GGCC	2	8	51676	51683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008538	GGC	2	6	51711	51716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008538	T	6	6	51765	51770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008538	CAAC	2	8	51784	51791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008538	CA	3	6	52889	52894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008538	C	6	6	52904	52909	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_008538	CGAC	2	8	52941	52948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008538	CCA	2	6	53997	54002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008538	TCT	2	6	54745	54750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008538	GAA	2	6	54933	54938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008538	AAG	2	6	55033	55038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008538	GCA	2	6	55685	55690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008538	AAC	2	6	55709	55714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008538	CGG	2	6	55757	55762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008538	CGC	2	6	55773	55778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_008538	CA	3	6	55840	55845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008538	GATG	2	8	56059	56066	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008538	CGG	2	6	57740	57745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008538	CGG	2	6	57787	57792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008538	TG	3	6	63441	63446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008538	CCA	2	6	63450	63455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008538	GGA	2	6	63493	63498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008538	TCC	2	6	64787	64792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_008538	CGCCT	2	10	64824	64833	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_008538	TGA	2	6	64918	64923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008538	GGA	2	6	64956	64961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008538	GTGG	2	8	64968	64975	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008538	CCTG	2	8	64984	64991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008538	GGT	2	6	65079	65084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_008538	GC	3	6	65136	65141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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183	NC_008538	TCG	2	6	68429	68434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_008538	GA	3	6	94609	94614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
289	NC_008538	GTT	2	6	94738	94743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_008538	GGT	2	6	94786	94791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_008538	CTG	2	6	94817	94822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_008538	CAG	2	6	94842	94847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_008538	CT	3	6	99088	99093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
294	NC_008538	CTC	2	6	101240	101245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_008538	TC	3	6	101244	101249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
296	NC_008538	CCG	2	6	101280	101285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
297	NC_008538	CTG	2	6	101303	101308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_008538	GT	3	6	101353	101358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
299	NC_008538	TC	3	6	101374	101379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
300	NC_008538	TGG	3	9	101409	101417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
301	NC_008538	TGT	2	6	101478	101483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_008538	CCA	2	6	107541	107546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
303	NC_008538	G	6	6	108452	108457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
304	NC_008538	TCCA	2	8	108458	108465	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
305	NC_008538	TGG	2	6	108478	108483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
306	NC_008538	CTG	2	6	108511	108516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_008538	CGG	2	6	108594	108599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
308	NC_008538	GTC	2	6	108740	108745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
309	NC_008538	TTG	2	6	111441	111446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
310	NC_008538	GTC	2	6	115434	115439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
311	NC_008538	AGC	2	6	115467	115472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_008538	TGC	2	6	115491	115496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.